Semaine du 8 au 14 mars 2021 : trois fois plus de tests salivaires que la semaine précédente dans un contexte de hausse du nombre total de tests

Entre le 8 et le 14 mars 2021, 2 401 300 résultats de tests RT-PCR et antigéniques ont été validés (dont 27,2 % de tests antigéniques et 3,0 % de tests RT-PCR salivaires), contre 2 186 800 (dont 26,1 % de tests antigéniques et 1,0 % de tests RT-PCR salivaires) la semaine précédente, soit une augmentation de 214 500 tests. En lien avec les dépistages en milieux scolaires, le nombre de tests salivaires a été multiplié par 3 par rapport à la semaine précédente pour atteindre 73 400 prélèvements.

La part des tests (ensemble des RT-PCR et antigéniques) validés en moins de 24 h est en légère diminution à 91 %, contre 93 % la semaine précédente. La médiane et la moyenne des délais entre prélèvement et validation du résultat restent constantes, respectivement à 0,4 et 0,6 jour.

Le nombre de tests RT-PCR et antigéniques réalisés entre le 8 et le 14 mars 2021 est en nette augmentation pour les patients de 15 ans ou moins et en légère augmentation pour les patients de 16 à 65 ans.

La médiane et la moyenne des délais entre prélèvement et validation du résultat restent à leur niveau plancher, respectivement à 0,4 et 0,6 jour.

La part des tests RT-PCR validés en moins de 24 h est en légère diminution à 88 %, contre 91 % la semaine précédente.

Près de 3 départements sur 4 ont un délai médian entre prélèvement et validation du résultat d’un test RT-PCR inférieur à 12 h.

Un peu plus d’un test sur 4 est un test antigénique.

Dans quatre départements la part des tests antigéniques dépasse 40 % : Mayotte (976), Paris (75), la Seine-Saint-Denis (93) et la Moselle (57) (Carte 3).

Les tests salivaires quant à eux représentent moins de 5 % des tests réalisés dans près de 75 % des départements, et moins de 10 % dans plus de 90 % des départements (Carte 4).

Sur l’ensemble des tests (RT-PCR et antigéniques) réalisés la semaine du 8 au 14 mars 2021, la part des tests validés en moins de 24 h s’élève à 91 % (Graphique 5), contre 93 % la semaine précédente. Si l’on considère le délai en journées, et non plus en heures, ce sont 98 % des tests dont le résultat a été validé le jour ou le lendemain du prélèvement (graphique 6), contre 99 % la semaine précédente.

Méthodologie

La DREES exploite les données pseudonymisées du système d’information SI-DEP, qui portent notamment sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés par les laboratoires d’analyse médicale, et comportent des informations à la fois sur les résultats des tests et sur leurs délais de réalisation. Le calcul des délais pour les tests RT-PCR se fait à partir de la date de prélèvement du test (jour, heure, minute), déclarée par le laboratoire, et de la date d’intégration (jour, heure, minute) du test dans le système d’information, intégration qui doit se faire très rapidement après la validation du test. Les délais ici présentés pour les tests RT-PCR correspondent aux délais entre la date de prélèvement et la date d’intégration des résultats dans SI-DEP. Cependant, la date d’envoi des résultats aux patients par le laboratoire peut être postérieure à l’intégration des résultats dans SIDEP. Les délais entre date de prélèvement et réception des résultats des tests RT-PCR par les patients pourraient donc être supérieurs à ceux mesurés via SIDEP. Les statistiques présentées portent sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés, en date de validation du résultat.

Depuis le 17 octobre, les tests antigéniques sont autorisés dans le cadre des dépistages individuels. Ils doivent être remontés depuis lors dans la base SIDEP par les laboratoires. En revanche, la saisie d’information dans SIDEP pour les professionnels de santé n’est possible que depuis le 16 novembre, et a connu une phase de montée en charge. Afin d’estimer le nombre total de tests antigéniques réalisés depuis le 17 octobre, la DREES utilise les données de l’Assurance maladie sur le nombre de tests remboursés en date de soins en complément des données renseignées dans SIDEP. Les tests antigéniques sont des tests pour lesquels le résultat est connu très rapidement, avec un délai entre prélèvement et validation du résultat généralement inférieur à 30 minutes.

Par ailleurs, si une même personne a réalisé successivement deux tests, ces deux tests sont donc comptés. Les données sur le nombre de tests diffèrent de celles publiées par Santé Publique France, en date de prélèvement du test.

Enfin, entre début mars et début juin 2020, préalablement au déploiement complet de SIDEP, la DREES a mis en place à la demande du centre de crise sanitaire un système d’information permettant de comptabiliser le nombre de tests RT-PCR réalisés en France, à partir des déclarations des sites réalisant les tests (et non les prélèvements comme dans SIDEP).

Dans le cadre de l'exploitation des données SIDEP, la DREES procède à quelques retraitements des données. En particulier, les tests remontés avec un pseudonyme manquant sont supprimés. Dans le cas d'un même test remonté plusieurs fois (mise à jour de certaines informations sur le patient par exemple), la DREES conserve la ligne la plus récente, à l'exception de la date d'intégration dans SIDEP dont on retient la valeur la plus ancienne, assimilée à la date de validation du résultat.